我用 OpenClaw 跑了一次 MD，开始重新理解“科研门槛”
如果把时间拨回到几年前，分子动力学模拟（MD）在很多人眼里，还是一项相当“硬核”的科研技能。
你要会连服务器，要懂 Linux，要会看集群队列，要知道怎么写 PBS 脚本；你要熟悉 GROMACS，知道怎么准备体系、怎么跑模拟、怎么做后处理；你还得会 Python，懂 MDAnalysis，会读轨迹、会提参数、会画图、会解释结果。更现实的是，你必须经历无数次环境报错、依赖冲突、脚本失败、格式不兼容，才能慢慢积累出一种“我会跑 MD”的能力感。
这套东西，曾经构成了很多科研工作者最真实的门槛。
但最近，洪亮课题组的一位学生仅仅通过和OpenClaw（下称“龙虾”）连续对话，就完成了一整套 MD 工作流：从环境安装、参数配置、轨迹运行，到后续分析与结果输出，过程中还不断遇到各种报错。无论是初学者还是有经验的人，这些问题其实都并不陌生——过去往往只能反复检查代码、请教有经验的人，或者自己一点点查资料、踩坑解决。而现在，这些原本可能要摸索数周甚至更久的问题，已经可以通过对话被大幅压缩至几小时去解决。
这件事最让人让人印象深刻的，不是“AI 会写脚本”，而是它把过去一整套需要长期训练、反复踩坑才能掌握的技能，压缩成了几小时内的一段对话。
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更关键的是，这不是那种“理想条件下的一次丝滑演示”。真实科研里的麻烦，一个都没少——队列资源不足、节点切换、conda 激活失败、依赖缺失、文件格式不兼容、分析任务失败后重提......以前，这些问题往往要靠研究者自己一点点排查；现在，龙虾已经可以识别问题、修复流程并重新执行。
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这件事深深震惊了课题组的资深 PI，尤其是洪亮教授本人。
他在组会上分享时说，自己 2010 年在美国橡树岭国家实验室做博士后时，正是靠学习 MD 这门专业技术，把它当作求生技能和科研手段，才一步步做出工作、发表文章。回国后建立课题组，再把这套技能传给学生，让他们继续把它当作科研训练和生存能力的一部分。
但今天，短短一段“和龙虾聊天”的过程，却让他第一次真切感受到：原来这样一整套曾经支撑一代科研人立身的技术门槛，已经低到了这种程度。
MD 当然不会消亡。作为一种非常有用的计算化学技术，它还会继续存在，也还会继续在很多研究里发挥作用。真正变化的，不是技术本身，而是普通使用者进入这门技术的门槛，正在被龙虾急剧拉低。
今天，一个原本做湿实验的同学，或者一个并不以计算见长的科研工作者，已经可以通过和“龙虾”这样的对话智能体聊天，完成相当不错的 MD 工作流。尤其当它还能调用资深专家调教过的技能包（skill）时，最终效果甚至可能在一天之内，就超过过去一个优秀初学者一年摸索所能达到的水平。
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大量以“熟练度”和“经验积累”为核心的知识，正在快速贬值。不是说这些知识马上就一文不值了，而是它们作为门槛、作为壁垒、作为区分“会”和“不会”的那种价值，正在变得越来越脆弱。以前，能独立跑完一次 MD、独立做完一套分析，是一种很明确的技能优势；以后，这种优势可能不再来自“你会不会执行”，而来自“你知不知道该执行什么”。
说得更直接一点：在 OpenClaw 这样的 agent 冲击下，很多经典领域里依赖熟练度、经验积累和流程训练建立起来的知识壁垒，正在失效。问题不是“AI 会不会替代科研”，而是“科研里哪些部分会先被替代”。越是成熟、越是标准化、越是“有章可循”的领域，越容易最先被 AI 重构。
这也迫使今天的年轻研究者重新思考：在新的技术条件下，自己的时间和精力究竟应该更多投入到哪里？是前人开发的技术，还是学习和打造定义问题的能力？
如果说“我用 OpenClaw 跑了一次 MD”有什么真正值得记录的地方，那不是“以后科研更方便了”，而是它提醒我们：旧时代很多看似坚固的门槛，已经开始松动了。
也正因为如此，未来真正重要的，或许不再只是对既有流程的熟练掌握，而是提出问题、形成判断、不断试错并找到新路径的能力。我们也期待更多有想法、有创新意识、敢于探索的学生加入课题组，在这个门槛被重新定义的时代，一起做真正重要的新问题。
关于
洪亮课题组
洪亮，上海交通大学特聘教授，物理天文学院 & 生命科学与技术学院 & 电子信息与电气工程学院 & 药学院 博导。获得科技部重大项目，基金委重点项目，面上项目，上海市科委，教委重大项目。累计发表 SCI/CCF 论文 90 余篇，其中包括 40 余篇高影响力论文发表于Nature, PNAS, Science Advances, Nature Communications 等知名期刊及 NeurIPS, ICLR 等计算机顶级会议。
实验室主页：
http://t.cn/AXVYHuoq
国内外最早一批致力于大模型在蛋白质工程，代谢工程的开发与应用。开发了 Venus 系列人工智能模型，构建了高质量的蛋白质数据库、标签库，提出行业技术标准，并为AI量身定制了自动化设备，用于蛋白质的定向进化和挖掘。目前已经实现多个产业化案例，获得国内外近 50 家企业合作和支持，在该方向发表多篇高水平文章。
学术任职：
1. 上海交通大学张江高等研究院人工智能生物医药中心（主任）。
2. 上海人工智能实验室 顾问科学家。
课题组资源：
1. 实验室具有为 AI 定制化开发的湿实验自动化平台，各种生物检测设备一应俱全，支持产品落地研究，鼓励跨学科交叉合作。
2. 实验室具有 H100/4090/3090 集群，有丰富的计算资源，支持高计算开销模型训练与开发。
研究方向：
1. 基于AI的菌株设计和改造。
2. 基于AI的酶改造、酶挖掘。
3. 生物学大模型的开发与应用。
生物医药智能体研发。
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